Tissue Detail

組織の関連情報を出力

Query
Query Type
Query
Keyword
Tissue Name
Output
​タブ名
Summary
解説
組織のSummary、外部参照データ(Database Reference)が表示
​タブ名
Synonym
解説
Synonym /タームごとの文献数
​タブ名
ChEMBL Target
解説
ChEMBLに登録された当該組織情報がテーブル表示
​タブ名
Disease
解説
関連する疾患の文献数/発現実験数(Array Exp)/SRA登録数/PDB数の表示
​タブ名
Specific Expression Gene
解説
当該組織に特異的に発現している遺伝子をRefEx、UniProt Comment、 発現実験を基に表示
・組織別表示発現遺伝子を逆引きが可能
​タブ名
Species Specific Expression
解説
動物種別により 当該組織に特異的に発現している遺伝子(オルソログ)を表示
・疾患や毒性発現部位における 動物種による 共通発現遺伝子の比較が可能
​タブ名
Assay
解説
組織に関連するAssay情報を表示。
・Assay Type/Act Outcome Method/Title/Protein/Relationship Type/Confidence Score/BAO Format/Activities数/化合物数/Details
​タブ名
Activities
解説
組織に関連するAssayで使用された化合物とその活性値情報を表示
・LSKB Chemical(構造)/Target/Activity Status/Activity Type/ Relation/Value/Units/pACT/Assay Value/Assay Type/Act Outcome Method/Title/PubMed/Comment
注) 件数の多い Activities情報はバッチ処理を行います。
OKを押して暫くお待ちください。終了後、テーブルが現れます。また、この結果は保持されるため 2回目以降は早く表示されます。
​タブ名
Gene Expression
解説
Assay Type=ToxicityのAssay情報
・組織に関連する遺伝子発現実験(GEO/GDS Expression Atlas)を表示
・ID/Title/Description/Organism/Detailへのリンク
PDF マニュアル
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Example

Tissue to Spiecies Specific Gene expression

Tissue to Spiecies Specific Gene expression

組織 pituitary gland anteriorにおける発現遺伝子をオルソログ遺伝子でRefEx UniProt Comment 、発現解析データで 比較表示

Tissue to Disease

Tissue to Disease

組織 pituitary gland anteriorに関連する疾患を文献、遺伝子発現実験、SRA(NGS解析)、PDBのアノテーション にてテーブル表示

Tissue Summary

Tissue Summary

組織pituitary gland anterior のサマリー情報と 関連リンク さらに 年代別の文献数をグラフ表示