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Taxonomy

Taxonomy ID to Pharmacological Action

入力したTaxonomy IDに関連する MeSHのPharmacological ActionのPubMed文献のテキストマイニングで求めた関連情報を出力します。
結果は 次のテーブルで出力されます。
Term/ rsID数/文献数(3つのレベル)

Taxonomy ID to Report

入力した複数のTaxonomy IDから関連するTaxonomy情報のサマリーを取得します。
・Taxonomy ID
・名称(Name)
・Rank
・ 当該Taxonomyの遺伝子数(# of Gene)
・ 当該Taxonomyのタンパク質数(# of UniProt(SwissProt))
・ChEMBLとPubChem Bio Assayからのターゲット数(# of Assay Target)
・文献数(#) of PubMed
・ テキストマイニング共起の関連疾患数(Related Disease)
・テキストマイニング共起の化合物数(Related Chemical)
・テキストマイニング共起の関連組織数(Related Tissue)
・テキストマイニング共起の関連生物種数(Related Spiecies)

Taxonomy ID to Protein

結果は 次のテーブルで出力されます。
・UniProt Entry Name
・UniProt Accession(ACC)
・Description
・TAXID/
・Taxonomy Name

Taxonomy ID to Assay

入力した複数のTaxonomy IDからChEMBLとPubChem Bio Assayを同時検索し、関連するAssay Targetを取得します。
アッセイ経由で微生物と活性化合物をつなげるにはこちらを利用してください。
アッセイターゲットの情報は、
・ターゲットのChEMBL ID/
・名称(Preferred Name)/
・UniProt Accession
・Target Type/
・Organism/化合物数(Compounds)/
・活性情報数(Bioactivities)

Taxonomy ID to MeSH

MeSHの次の項目についてカテゴリ毎にPubMed文献のテキストマイニングで求めた関連情報を出力します。
・Health Care
・Persons
・Technology and Food and Beverages
・Humanities
・Psychiatry and Psychology
・Disciplines and Occupations
結果は 次のテーブルで出力されます。
Term/ Taxonomy ID数/文献数(3つのレベル)

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