Disease Detail

疾患と関連情報を出力

Query
Query Type
Query
Keyword
疾患名
Output
​タブ名
Summary
解説
Therapeutic Target/ 疾患のSummary表示
外部データソース(Database Reference)へのリンク
​タブ名
Annotation
解説
・Synonym: Synonym名 /タームごとの文献数
・Phenotype: 3つのレベルでの文献テキストマイニングで求めたPhenotypeを表示
・Micro Organism: 3つのレベルでの文献テキストマイニングで求めたウィルス と細菌、ターゲット情報、アッセイ数を表示
・Pathway : 疾患に関連するPathway情報をテーブル表示
・Tissue: 疾患に関連する組織情報を表示(文献数/Array Exp/SRA/PDB)
・SRA: 疾患に関連する次世代シーケンサー解析データSRA情報が表示されます
・GWAS Catalogue: テキストマイニングで求めたGWAS Catalogueの表示
​タブ名
Protein
解説
疾患のターゲットタンパク質のクラスを開発状況とともに表示
ターゲット別に薬剤の/OMIM/MeSH/TTD ID/ChEMBL Target Detailを表示(more…)
・左側に当該疾患のターゲットタンパク質のクラスを開発状況(後期Phase4/3 および 早期 Phase2/1)の切り替えと疾患の開発状況の件数をスライドバーで調整し表示します。
・右側は ターゲット別に薬剤の開発状況(P-4/P-3/P-2/P-1)とOMIM/MeSH/TTD ID/ChEMBL Target の情報がまとまり、進行状況が高い順にテーブル出力されています。
​タブ名
Classification
解説
疾患分類を表示、上位クラスでの解析が可能に
・Graphでは 疾患のMeSH Classificationを 表示
・Textでは MeSH および ICD10 のClass 分類を記載します。
​タブ名
Drug
解説
疾患に関連するDrug情報表示
LSKBChemID/構造/Molecule Type/Max Phase /Withdrawn/ATC Class/Mechanism of Action/Action Type/Target/Clinical Trial/TTD/3つのレベルによるテキストマイニングの文献数/GO/MoA/GO-MoA
​タブ名
GO Ranking
解説
GO-MoA によって解析した疾患に関連するGO(Biological Process)を表示。
GO(Biological Process)/ GO Term(Original)/HitしたGene数/ GOに含まれるGene数/p-Value/Reference/関連するMoA数/関連するDrug数/Considerable Drug数/関連遺伝子に対しての活性化合物数
​タブ名
Gene
解説
疾患関連遺伝子を 3つのレベルによるテキストマイニングの文献数/MedGen/OMIM/HPO(Human Phenotype Ontology)/Gene Expression/Protein/Bind(Kd/EC50をエンドポイントとするBinding の化合物数)/Inhibit(Ki/IC50をエンドポイントとするBinding の化合物数)の表示
​タブ名
SNPs(hg38)(hg19)
解説
ClinVarとテキストマイニングで求めたSNPの表示
Ligand 情報は 変異から6A以内のリガンドを示す
​タブ名
Gene Expression
解説
疾患に関する遺伝子発現実験(GEO/GDS Expression Atlas)を表示
ID/Title/Description/Organism/Detailとサイトへのリンク
​タブ名
Clinical Trial
解説
疾患に関連する臨床試験(Clinical Trials.gov)のサマリー
PDF マニュアル
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