Disease Detail

疾患と関連情報を出力

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Query Type
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Keyword
疾患名
Output
​タブ名
Summary
解説
疾患のSummary
PubMed 共起文献のテキストマイニングによる関連情報のランキング
外部データソース(Database Reference)へのリンク
Therapeutic Target 表示
​タブ名
Annotation
解説
・Synonym: Synonym名 /タームごとの文献数
・Phenotype: 3つのレベルでの文献テキストマイニングで求めたPhenotypeを表示
・Micro Organism: 3つのレベルでの文献テキストマイニングで求めたウィルス と細菌、ターゲット情報、アッセイ数を表示
・Pathway : 疾患に関連するPathway情報をテーブル表示
・Tissue: 疾患に関連する組織情報を共通テーブルビューアーで表示(文献数/ホモニム数/Array Exp/SRA/PDB/Array Express GO Gene数)
・SRA: 疾患に関連する次世代シーケンサー解析データSRA情報が表示されます
・GWAS Catalogue: テキストマイニングで求めたGWAS Catalogueの表示
​タブ名
Protein
解説
疾患のターゲットタンパク質のクラスを開発状況とともに表示
ターゲット別に薬剤の/OMIM/MeSH/TTD ID/ChEMBL Target Detailを表示(more…)
・左側に当該疾患のターゲットタンパク質のクラスを開発状況(後期Phase4/3 および 早期 Phase2/1)の切り替えと疾患の開発状況の件数をスライドバーで調整し表示します。
・右側は ターゲット別に薬剤の開発状況(P-4/P-3/P-2/P-1)とOMIM/MeSH/TTD ID/ChEMBL Target/G2P(Guide To Pharmacology) の情報がまとまり、進行状況が高い順にテーブル出力されています。
​タブ名
Classification
解説
疾患分類を表示、上位クラスでの解析が可能に
・Graphでは 疾患のMeSH Classificationを 表示
・Textでは MeSH および ICD10 のClass 分類を記載します。
​タブ名
Drug
解説
疾患に関連するDrug情報表示
LSKBChemID/構造/分子量/Molecule Type/Max Phase /Withdrawn/ATC Class/Mechanism of Action/Action Type/Target/Clinical Trial/TTD/3つのレベルによるテキストマイニングの文献数/ホモニム数/GO/MoA/GO-MoA/疾患サマリーの化合物の記載/化合物サマリー中の疾患の記載
​タブ名
GO Ranking
解説
GO-MoA によって解析した疾患に関連するGO(Biological Process)を表示。
​タブ名
Gene
解説
GO(Biological Process)/ GO Term(Original)/HitしたGene数/ GOに含まれるGene数/p-Value/Reference/関連するMoA数/関連するDrug数/Considerable Drug数/関連遺伝子に対しての活性化合物数
​タブ名
SNPs(hg38)(hg19)
解説
ClinVarとテキストマイニングで求めたSNPの表示
Ligand 情報は 変異から6A以内のリガンドを示す
​タブ名
Gene Expression
解説
疾患に関する遺伝子発現実験(GEO/GDS Expression Atlas)を表示
ID/Title/Description/Organism/Chemical/Disease/Detail
​タブ名
Clinical Trial
解説
疾患に関連する臨床試験(Clinical Trials.gov)のサマリー
​タブ名
GO-MoA
解説
GO-MoA をもちいて、疾患に関連するGOの機能から、新しいターゲット遺伝子、新しいDrug の候補を探す機能。
着目した疾患関連GO(Biological Process)から、
1) その作用を有する遺伝子で、疾患ターゲットではない 遺伝子
2) その作用をもつMoA から、疾患に適応を持たない 薬剤をリストアップ
PDF マニュアル
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Example

ALSに関連するGene 一覧

ALSに関連するGene 一覧

ALSに関連するGene を取り纏め、関連文献、ホモニムの有無、Pathway、OMIM、MedGenへの記載、Gene RIFなどの項目から Confidence Scoreでランキングしてテーブル表示表示

ALSに関連するProtein情報

ALSに関連するProtein情報

左はALSに対して臨床試験でP-2/1にある薬剤のターゲットタンパク質のクラスを表示、右は対応するタンパク質のリストをテーブル表示

ALSに関連するProtein一覧

ALSに関連するProtein一覧

ALSに対するターゲットタンパク質、作用様式と臨床試験の状態、OMIMやMedGen ターゲットのアサインをテーブル表示

ALSに関連するGene Expression情報

ALSに関連するGene Expression情報

ALSに関連するGene Expression情報をGEO、Expression Atlasから取り纏めたテーブルで、サマリーには発現遺伝子のリストが取得できます。

ALSに関連するDrug 一覧

ALSに関連するDrug 一覧

ALSに関連するDrug を取り纏め、分子量、Molecule Type、MoA、ターゲットに加えて臨床試験、文献情報、サマリーでの記述の有無などをテーブル表示しています。