Target Detail

Gene Symbol/Gene ID/Gene Name/Protein Name/UniProt Accession/Entry Name/EC number 他、任意のターゲットの名前を入力として検索すると、Gene/Protein/EC/Target を同時に検索し、個別のタブにてヒットしたタームについて出力します。

Query
Query Type
Query
Keyword
遺伝子名
Output
​タブ名
Basic
解説
Target Type: 30種のTarget Typeから記載
Name:ターゲット名
Taxonomy: 生物種
以下 データソース、Target Typeにより記載項目が変更される。以下は 例
ChMEBL Target ID:
ChMEBL Preferred Name:
G2P Target ID:
Family
​タブ名
Annotation
解説
Synonym, mRNA, Ortholog, Gene Ontology, OMIM
・Synonym タブでは Gene Symbol/Gene Name/タームごとの文献数 がテーブルとして出力されます。
・mRNAタブでは当該Geneに関連する mRNAが Accession/Description/Link がテーブルとして出力されます。
・Orthologタブでは当該Gene のOrhtholog が表示されます。
・Gene Ontology タブでは当該Gene の Gene Ontologyが表示されます。
・OMIMタブでは 当該Gene の関連OMIM情報が表示されます。
​タブ名
Protein
解説
ターゲットのProtein情報(UniProt)の表示と詳細情報へのリンク
・Protein Name/ID/UniProt(Entry Name/Descriptionのテーブル表示。
​タブ名
Assays
解説
当該ターゲットのアッセイ情報をリストアップ
・以下の要素で テーブル出力されます。
Assay Type/Act Outcome Method/Title /Target/Protein/Relationship Type/Confidence Score /BAO Format/# of Activities/# of Chemicals /Details
​タブ名
Activities
解説
当該ターゲットのアッセイの個々の結果をリストアップ
・以下の要素で テーブル出力されます。
・LSKBChemID/構造/Assay Status/Active Type/Relation/Value/Units/pACT /Assay Values/Assay Type/ Act Outcome Method/Title /PubMed/Comment
PDF マニュアル
pdf.jpg
Example

Assay Target's Assay Information

Assay Target's Assay Information

chymaseをアッセイターゲットにする アッセイ情報を、各アッセイの分類、Confidence Score、活性値、化合物数など テーブル表示

Assay Target's Activity Information

Assay Target's Activity Information

アッセイに紐づいたターゲットchymaseの詳細で 評価された化合物とその活性値 コメント、文献情報をテーブル表示

Target Search to Assay Target

Target Search to Assay Target

chymaseの名前を含むアッセイターゲットがそのTarget Type、タンパク質とともに表示され、ターゲット の名前のクリックによりターゲットの詳細、活性化合物などの情報を取得できます。

Target Search to Protein with Assay & MoA

Target Search to Protein with Assay & MoA

chymaseの名前を含むタンパク質候補をアッセイのターゲット情報、MoAとともに表示、Entry Nameのクリックにより Protein Detailが表示され、さらにタンパク質とさまざまな関連情報を取得できます。

Target Search to Gene

Target Search to Gene

chymaseの名前を含む遺伝子候補を一致度の高いもの、Humanを上位に表示、Gene SymbolのクリックによりGene Detailが表示、さらに遺伝子とさまざまな関連情報を取得できます。

Target Search to EC

Target Search to EC

chymaseのECクラスを表示、酵素のクラス(EC)詳細で同一クラスのタンパク質のリストとその解析につながる。