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Gene ID to Disease Explorer

遺伝子リストから 関係性の高い疾患を探索します。

この検索では、入力したGene IDに関連性の高い疾患をスコアによりランキングできます。
ランキングで各種データベースを串刺し検索しています。ランキングの指標はConfidence Scoreで表し、以下のデータベースの検索結果の件数に重み付けを行って計算しています。

・OMIM:OMIMによる疾患と遺伝子の関連性
・MedGen:MedGenに疾患と遺伝子の関連性
・Human Phenotype Ontology:Human Phenotype Ontologyにおける遺伝子の関連性と疾患関連Phenotypeにおける一致
・Array Exp:疾患関連発現実験における変動遺伝子との合致数
・Gene RIF:GeneRIFのテキストマイニングによる疾患遺伝子の関連性
・SNPs (rsID):疾患に関連する遺伝子のSNP
・3つのレベルの文献数(疾患とrsIDが共起された文献数、LV1ではセンテンス内共起、LV2ではセンテンス共起、かつ何らかの機能用語が含まれる):テキストマイニングにおける遺伝子と疾患の共起文献数
・Pathway:疾患関連Pathwayと関連遺伝子
・Therapeutic Target:疾患に対するTherapeutic Targetとの合致
・Max Phase Drug/Exp:疾患に対し 当該遺伝子をターゲットとする治療/治験薬の最大フェーズ

検索に利用するクエリーと例
【Entrez Gene IDリスト】
80332
163486
57628
4589
94103
サンプルクエリーデータ
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