Gene ID to PubMed Concurrent Relation --- Gene, Chemical, Disease, Tissue
文献情報により遺伝子リストから 指定カテゴリータームのランキング
Query
Query Type | Query |
|---|---|
ID | Gene ID （Entrez Gene ID）リスト |
Output
タブ名
N/A
解説
文献の共起情報により、入力したGeneIDに関連性の高い要素（Gene,Chemical,Disease,Tissue いずれかを選択）に 対して大まかな関係性において選択した要素（例えば、Disease）をランキングします。
選択した要素のターム の入力した遺伝子に対する関係性が Poisson95（default）でランキングされ、数字の列は入力したGene IDの順に示され、オンマウスで表示されます。ランキングされた要素と Gene IDを示す数字の交点 には 共起文献数が記載され、クリックで文献のリストが得られます。
PDF マニュアル
サンプルデータ
サンプルデータを利用した解析例
Multiple Sclerosis のターゲット5遺伝子による文献での関連疾患
Multiple Sclerosis のターゲット5遺伝子からPubMedの解析により関連疾患と各遺伝子との文献数で30位までのランクキング、当該疾患が確認できます。