Gene ID to PubMed Concurrent Relation --- Gene, Chemical, Disease, Tissue

文献情報により遺伝子リストから 指定カテゴリータームのランキング

Query
Query Type
Query
ID
Gene ID (Entrez Gene ID)リスト
Output
タブ名
N/A
解説
文献の共起情報により、入力したGeneIDに関連性の高い要素(Gene,Chemical,Disease,Tissue いずれかを選択)に 対して大まかな関係性において選択した要素(例えば、Disease)をランキングします。
選択した要素のターム の入力した遺伝子に対する関係性が Poisson95(default)でランキングされ、数字の列は入力したGene IDの順に示され、オンマウスで表示されます。ランキングされた要素と Gene IDを示す数字の交点 には 共起文献数が記載され、クリックで文献のリストが得られます。
PDF マニュアル
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サンプルデータ
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サンプルデータを利用した解析例

Multiple Sclerosis のターゲット5遺伝子による文献での関連疾患

Chymase_SP_Assays.png

Multiple Sclerosis のターゲット5遺伝子からPubMedの解析により関連疾患と各遺伝子との文献数で30位までのランクキング、当該疾患が確認できます。