Add annotations to Compound
化合物アノテーション情報収集

化合物のアノテーション情報・プロパティ値を収集する

Retrieve molecular properties
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各分子のプロパティ値を追加
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、各分子のプロパティ値を格納した列を追加

化合物一覧表にRDKitで計算した各分子のプロパティ値(MW,MolLogPTPSA,HB Acceptor count,HB Donor count)を格納した列を追加

Retrieve molecular connectivity indexes
Seek_GeneProtein_keyword.png
各分子のConnectivity Index値を追加
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、各分子のConnectivity Index値を格納した列を追加

化合物一覧表にRDKitで計算した各分子のConnectivity Index(χ-index、κ-index)を格納した列を追加

Retrieve assay attributes
Seek_GeneProtein_keyword.png
化合物一覧表に各分子に紐づいているAssayのタイプを概略的に表示する
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、各分子に紐づいているAssayのタイプを格納した列を追加

化合物一覧表に各分子に紐づいているAssayのAssayタイプを概略的に表示する

Retrieve ChEBI annotations
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化合物一覧表に、ChEBIから収集したアノテーションを格納した列を追加する
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、ChEBIから収集したアノテーションを格納した列を追加

化合物一覧表に、ChEBIから収集したアノテーションを格納した列を追加する

Retrieve MeSH tree
Seek_GeneProtein_keyword.png
化合物一覧表に、MeSH Treeの情報を追加する
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、MeSH Treeの情報を追加

化合物一覧表に、MeSH Treeの情報を追加する

Retrieve molecular functions
Seek_GeneProtein_keyword.png
化合物一覧表に、Molecular Functionの情報を追加する
入力
化合物一覧(Workflowで保持)
出力
化合物一覧表に、Molecular Functionの情報を追加

化合物一覧表に、Molecular Functionの情報を追加する