Seek Compounds by structure search
構造検索で化合物を取得
入力
化合物構造と検索条件、検索対象のデータセットの指定
出力
Hit Molecules タブに 該当する化合物の構造と名前、関連リンク
を出力します。
構造検索機能を利用して、LSKBのデータベースから化合物を収集します。
編集エリアに表示される部品（上左図）の中にある「Edit」ボタンを押すと、化合物スケッチャが開き、検索クエリの構造・検索動作と検索対象データセットを選択できるようになっています。検索クエリの構造編集をキャンセルするときは、右上の❎アイコンをクリックします。
Seek Compounds by LSKB ChemID
LSKB ChemIDで化合物を取得
入力
LSKB ChemID
出力
Hit Molecules タブに 該当する化合物の構造と名前、関連リンク
を出力します。
LSKBの化合物管理番号(LSKB ChemID)を利用して化合物構造を呼び出す場合に利用します。
Seek Compounds by Patent ID
特許番号を利用して化合物を取得
入力
特許番号
出力
Patenthits タブには 入力したPatent IDと化合物IDとの対応表
Hit Molecules タブには 該当する化合物の構造と名前、関連リンク
を出力します。
特許番号を利用して化合物を収集するのに利用します。入力可能な特許番号の書式は
CC-nnnn-KK
CC: Country Code
nnnn: Patent Number
KK: Kind Code
CCおよびKKは省略可能、ハイフンも有無を問いません。
Seek Compounds by Compounds currently held
前プロセスの化合物リストからの構造検索
入力
前プロセスまでで収集した化合物構造を元に構造検索を実行する
出力
入力した構造をクエリとした構造検索結果をリストアップ
data タブに 入力した構造情報
Hit Molecules タブには 該当する化合物の構造と名前、関連リンク
を出力します。
検索結果の化合物をクエリとして、指定した条件で再検索を実施
以下の検索方法とデータベースが選択できます。
【検索方法】
・Exact match w/o chirality
・Exact match with chirality
・Similarity search
【データベース】
・Small molecule
・Assay情報が紐づいた化合物
・全化合物
Seek Compounds by MoA/function associated
MoAやケモタイプ、作用などの機能用語から化合物を検索
入力
選択した機能用語
出力
Hit Molecules タブには 該当する化合物の構造と名前、関連リンク
Compounds by Function ID タブには 入力した 機能用語に対応する化合物IDを出力します。
選択欄の機能用語左側のチェックボックスをONにした用語に紐づいた化合物が収集されます。検索欄にキーワードを入れると、そのキーワードを含む機能用語のみが表示されます。
Retrieve protein-ligand Pairs, by Action Type
化合物Action Typeからタンパク質・化合物の組み合わせを作成
入力
化合物Action Type
出力
タンパク質、化合物とChEMBLのAssayとターゲット情報
化合物Action Type辞書に紐づいているタンパク質・化合物の組み合わせを、化合物Action Typeを指定して検索・収集するための部品です。
選択欄の各Action Type左側のチェックボックスをONにしたAction Typeに紐づいた蛋白質と化合物が収集されます。検索欄にキーワードを入れると、そのキーワードを含むAction Typeのみが表示されます。