Activitiy collection from PDB ID

PDB IDをキーとしてタンパク質を特定し、アッセイデータを収集する

● Query

● Output

PDB ID

活性値テーブル

PDBIDを入力してGene/Proteinを特定し、活性値を収集する。
活性値収集時の条件として以下の3つの条件を変更することが可能。
1)Retrieve activities without target protein entry name
ターゲットタンパク質名称がENTRY_NAMEで特定されていない情報であっても出力する
2)Retrieve activities without P_ACT value
LSKB統合アッセイのテーブルでP_ACTに値が入っていないような情報であっても出力する
3)Retrieve activities without ASSAY_TYPE
LSKB統合アッセイのテーブルでASSAY_TYPEに値が入っていない情報であっても出力する
また、フィルタ条件として付与している以下の条件を変更可能。
・pAct > 5

● お試し用サンプルファイル

5_collection.zip

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