Activity Finder Example: actives for human p38

任意キーワードでタンパク質を検索し、活性値と化合物を収集(human p38を例として入力済)

● Query

● Output

タンパク質を検索するキーワード

活性値テーブル
化合物テーブル

Gene/Proteinに関する任意のキーワードを一行一件で入力してそれらを収集する。(例として、キーワードp38を入力済み)
選択条件として、TAXID=9606(HUMAN)とEvidenceが空でないもの、という条件を付与済み(変更可能)。
他に、活性値収集時の条件として以下の3つの条件を変更することが可能。
1)Retrieve activities without target protein entry name
ターゲットタンパク質名称がENTRY_NAMEで特定されていない情報であっても出力する
2)Retrieve activities without P_ACT value
LSKB統合アッセイのテーブルでP_ACTに値が入っていないような情報であっても出力する
3)Retrieve activities without ASSAY_TYPE
LSKB統合アッセイのテーブルでASSAY_TYPEに値が入っていない情報であっても出力する

● お試し用サンプルファイル

None

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