Retrieve activities from LSKB integrated assay dataset

Item Category

Activity data handling

Input

遺伝子・タンパク質一覧(Workflowで保持)
化合物一覧(Workflowで保持)

※何れか、もしくは両方

Output

活性データ一覧表

LSKBの保持している活性データを収集する。以下のオプションで収集する活性データのフィルタリングが可能。
Retrieve activities without target protein entry name
活性データにターゲット蛋白質が未記載の場合でも収集する
Retrieve activities without P_ACT value
活性データに活性値の代表値(P_ACT)が未記載の場合にも収集する
Retrieve activities without ASSAY_TYPE
活性データにアッセイタイプの情報が未記載の場合でも収集する
Reject when DATA_VALIDITY_COMMENT is *NOT* empty
活性データの注釈に記載がある場合には除外する

この部品よりも前に遺伝子・タンパク質もしくは化合物を収集する部品(何れか、もしくは両方)が必要で、それらに記載されたタンパク質・化合物に関連する活性値が収集される。(両方ともに配置されている場合、両者に関連する活性値のみが収集される)

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